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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GenomeInfoDb。

公用事业操纵染色体和其他“seqname”标识符

Bioconductor版本:2.14

Seqnames包包含数据和函数定义,允许不同染色体之间的翻译顺序命名约定(例如,“chr1”和“1”),包括一个函数,它试图序列名称在自然,而不是字典式的秩序。

作者:Sonali Arora,马丁·摩根,马克•卡尔森h .页面

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

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文档

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browseVignettes (“GenomeInfoDb”)

PDF	R脚本	GenomeInfoDb: GenomeInfoDb概论
PDF		GenomeInfoDb GenomeInfoDb:提交你的生物体
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,DataRepresentation,遗传学,软件
版本	1.0.2中
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.1)
进口
链接
建议	BiocGenerics,IRanges,BSgenome,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene,RUnit,BiocStyle,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AnnotationDbi,GenomicRanges,Rsamtools
进口我	GenomicFeatures,SomaticSignatures,VariantTools
建议我	BSgenome,QDNAseq
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	GenomeInfoDb_1.0.2.tar.gz
Windows二进制	GenomeInfoDb_1.0.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	GenomeInfoDb_1.0.2.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	GenomeInfoDb_1.0.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/genomeinfodb/tree/release - 2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenomeInfoDb/
包下载报告	下载数据