要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneExpressionSignature”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GeneExpressionSignature

此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见GeneExpressionSignature

基于相似性度量的基因表达特征

Bioconductor版本:2.14

这个包给出了基因表达签名的实现及其与每个签名的距离。基因表达签名表示为其表达与感兴趣的生物状态相关的基因列表。使用基于Kolmogorov-Smirnov统计量的非参数、基于秩的模式匹配策略来定义它的距离。基因表达特征及其距离可用于检测药物、疾病和感兴趣的生物状态特征之间的相似性。

作者:曹阳

维护人员:曹阳在gmail.com> < yilu呵呵,李飞在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“GeneExpressionSignature”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneExpressionSignature”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GeneExpressionSignature”)

PDF GeneExpressionSignature
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpression软件
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.13),BiobasePGSEA
进口
链接
建议 apclusterGEOquery
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GeneExpressionSignature_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 GeneExpressionSignature_1.10.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) GeneExpressionSignature_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) GeneExpressionSignature_1.10.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GeneExpressionSignature/tree/release-2.14
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneExpressionSignature/
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文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心