##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GEOquery")

该软件包适用于Bioconductor的2.14版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GEOquery。

从NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)获取数据

Bioconductor版本:2.14

NCBI基因表达综合数据库(GEO)是微阵列数据的公共存储库。鉴于这种资源的丰富性和多样性，想要将BioConductor工具应用于这些数据是很自然的。GEOquery是GEO和BioConductor之间的桥梁。

作者:肖恩·戴维斯< sddavis2 at mail.nih.gov>

维护者:Sean Davis < sddavis2 at mail.nih.gov>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GEOquery")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“GEOquery”)

PDF	R脚本	GEOquery
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，微阵列，OneChannel，圣人，软件，TwoChannel
版本	2.30.1
在Bioconductor中	BioC 1.8 (R-2.3)(10年)
许可证	GPL-2
取决于	方法,Biobase
进口	XML，RCurl
链接
建议	limma
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/seandavi/GEOquery
这取决于我	DrugVsDisease，dyebiasexamples，GEOmetadb，扫描。通用产品
进口我	BeadArrayUseCases，ChIPXpress，SRAdb，virtualArray
建议我	antiProfilesData，dyebias，肘，GeneExpressionSignature，甲状旁腺，parathyroidSE，PGSEA，TargetScore
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源	GEOquery_2.30.1.tar.gz
Windows二进制	GEOquery_2.30.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	GEOquery_2.30.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	GEOquery_2.30.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GEOquery/tree/release-2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GEOquery/
软件包下载报告	下载数据