安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“CoverageView”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CoverageView。
Bioconductor版本:2.14
这个包提供了一个框架的可视化基因组覆盖率概要文件。它可以用于ChIP-seq实验,但它也可以用于全基因组核小体定位实验或其他类型的实验是很重要的有一个框架,以检查如何覆盖分布在整个基因组
作者:埃内斯托•罗伊
维护人员:埃内斯托罗伊< ernestolowy gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“CoverageView”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“CoverageView”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CoverageView”)
R脚本 | 简单的可视化的阅读范围 | |
参考手册 |
biocViews | ChIPSeq,RNASeq,测序,软件,技术,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(> = 2.10),方法,Rsamtools,rtracklayer |
进口 | IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments、平行、工具 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | CoverageView_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | CoverageView_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | CoverageView_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/coverageview/tree/release - 2.14 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CoverageView/ |
包下载报告 | 下载数据 |