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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ChIPQC。

ChIPseq数据质量指标

Bioconductor版本:2.14

ChIPseq数据质量指标

作者:汤姆·卡罗尔魏Liu Ines de圣地亚哥,罗里明显

维护人员:汤姆卡罗尔< tc.infomatics gmail.com >,罗里鲜明的<罗里。斯塔克在cruk.cam.ac.uk >

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browseVignettes (“ChIPQC”)

PDF	R脚本	评估与ChIPQC ChIP-seq样品质量
PDF		ChIPQCSampleReport.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,质量控制,ReportWriting,测序,软件
版本	1.0.9
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(2年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.0.0),ggplot2,DiffBind
进口	BiocGenerics(> = 0.8.0),Rsamtools(> = 1.14.2),GenomicRanges(> = 1.14.4),chipseq(> = 1.12.0),GenomicAlignments(> = 0.99.2),gtools,BiocParallel、方法、IRanges,reshape2,Nozzle.R1,Biobase,统计grDevices跑龙套
链接
建议	BiocStyle,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene,TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene,TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ChIPQC_1.0.9.tar.gz
Windows二进制	ChIPQC_1.0.9.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ChIPQC_1.0.9.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	ChIPQC_1.0.9.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/chipqc/tree/release - 2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPQC/
包下载报告	下载数据