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这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BiSeq。

处理和分析酸性亚硫酸盐测序数据

Bioconductor版本:2.14

BiSeq包提供有用的类和函数来处理和分析目标重亚硫酸盐测序(BS)数据如reduced-representation重亚硫酸盐测序(rrb)数据。特别是,它实现了一个算法来检测差异甲基化区域(dmr)。包已经对齐BS数据从一个或多个样本。

作者:卡佳Hebestreit,汉斯克莱因

维护人员:卡佳Hebestreit < katjah stanford.edu >

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PDF	R脚本	介绍BiSeq
PDF		参考手册

细节

biocViews	DNAMethylation,遗传学,MethylSeq,测序,软件
版本	1.4.2
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	LGPL-3
取决于	R(> = 2.15.2)、方法IRanges(> = 1.17.24),GenomicRanges,公式
进口	方法,BiocGenerics,Biobase,IRanges,GenomicRanges,rtracklayer平行,betareg,lokern,公式,globaltest
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	BiSeq_1.4.2.tar.gz
Windows二进制	BiSeq_1.4.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	BiSeq_1.4.2.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	BiSeq_1.4.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/biseq/tree/release - 2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiSeq/
包下载报告	下载数据