安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Basic4Cseq”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Basic4Cseq。
Bioconductor版本:2.14
Basic4Cseq是基本的R / Bioconductor包过滤、分析和后续4 c-seq数据的可视化。虚拟片段库可以创建任何BSGenome包,和过滤函数读取和碎片和基本的质量控制都包括在内。附近的片段数据实验的观点可以被可视化为覆盖图基于多尺度方法和中值运行联系资料。
作者:卡罗琳沃尔特
维修工:卡罗琳沃尔特<卡罗琳。沃尔特在uni-muenster.de >
从内部引用(R,回车引用(“Basic4Cseq”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Basic4Cseq”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Basic4Cseq”)
R脚本 | Basic4Cseq: R / Bioconductor包4 c-seq数据分析 | |
参考手册 |
biocViews | 质量控制,软件,可视化 |
版本 | 1.0.2中 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(2年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R (> = 3.0.0),Biostrings,ShortRead,caTools,GenomicRanges |
进口 | 方法,RCircos,BSgenome.Ecoli.NCBI.20080805 |
链接 | |
建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | Basic4Cseq_1.0.2.tar.gz |
Windows二进制 | Basic4Cseq_1.0.2.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | Basic4Cseq_1.0.2.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | Basic4Cseq_1.0.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/basic4cseq/tree/release - 2.14 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Basic4Cseq/ |
包下载报告 | 下载数据 |