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此包适用于Bioconductor 2.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见ArrayExpressHTS．

ArrayExpress高通量测序处理流水线

Bioconductor版本:2.14

用于公共ArrayExpress实验或本地数据集的RNA-Seq处理管道

作者:Angela Goncalves, Andrew Tikhonov

维护者:Angela Goncalves

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

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browseVignettes(“ArrayExpressHTS”)

PDF	R脚本	ArrayExpressHTS: RNA-Seq管道转录分析实验
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	RNASeq，测序，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证	艺术许可2.0
取决于	抽样，Rsamtools(> = 1.3.32),雪
进口	Biobase，BiocGenerics，Biostrings，DESeq，GenomicRanges，Hmisc，IRanges，R2HTML，RColorBrewer，Rsamtools，ShortRead，XML，biomaRt，刨边机， grDevices，图形，方法，rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailR，bitops
链接	Rsamtools
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	ArrayExpressHTS_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ArrayExpressHTS_1.14.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	ArrayExpressHTS_1.14.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/ArrayExpressHTS/tree/release-2.14
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpressHTS/
软件包下载报告	下载数据