版本新闻1.2.2修复了丹麦ret2=TRUE的错误。感谢Allegra A. Petti提供的bug报告1.2.1 tost() minfi和methylumi方法的固定注释方法。感谢一些用户提供的错误报告!0.99.16用ROC(生物导体)包替换了对ROCR的依赖,seabbird()不再为stop参数取向量。暂时删除了对ROCR(因此gdata) 0.99.14 MethylSet方法[dn]a[st]e[nt]现在返回包含规范化强度的对象,以及betas修复了一个错误。methylumi 0.99.13固定天鹅包装通用和MethyLumiSet方法错误0.99.12方法d****现在有…参数,这样没有Sentrix id的数据就可以工作(感谢Elodie Portales-Casamar提供的错误报告)。0.99.11 rgchannelsetexpfilter方法bug修复0.99.10 BioConductor提交0.9.8 MethyLumiSet方法现在更新历史插槽新的MethyLumiSet方法用于pfilter RGtoy2从数据中删除(minfitoy)。这是因为minfi现在期望清单是一个包。swan函数打了补丁,以便它可以处理数组数据的子集(由Jovana Maksimovic提供)。现在工作与瓜数据集。 as.methylumi generic function added. Gets fData from package:IlluminaHumanMethylation450k.db . The MethyLumiSet method is useful for ensuring methylumi objects contain this data. Andrew Teschendorff's BMIQ function and a MethyLumiSet method added minfi 1.4.0 has a changed manifest structure resulting in SNP probes being left out of the MethylSet. This breaks genki() for the minfi objects and also the minfitoy data() set.