要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“xcms”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见xcms.
Bioconductor版本:2.13
色谱分离和单谱质谱数据的处理和可视化框架。从AIA/ANDI NetCDF、mzXML、mzData和mzML文件导入。对高通量、非目标分析物分析的数据进行预处理。
作者:Colin A. Smith
维护者:Ralf Tautenhahn
引文(从R内,输入引用(“xcms”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“xcms”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“xcms”)
FlowChart.pdf | ||
R脚本 | 用xcms对FTICR-MS数据进行分组 | |
R脚本 | xcms安装说明 | |
R脚本 | 用xcms进行LC/MS预处理与分析 | |
R脚本 | 用xcms处理串联MS和MS$^n$数据 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
版本 | 1.38.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 2.14.0),方法,mzR(> = 1.1.6),BiocGenerics,Biobase |
进口 | |
链接 | |
建议 | faahKO,msdatancdf,乘,rgl,MassSpecWavelet(> = 1.5.2),RANN,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | RgraphvizKEGGSOAP,Rmpi,XML |
URL | http://metlin.scripps.edu/download/ |
全靠我 | 相机,faahKO,flagme |
进口我 | 相机,Risa |
建议我 | MassSpecWavelet,msdata,RforProteomics,RMassBank |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | xcms_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | xcms_1.38.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | xcms_1.38.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/xcms/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/xcms/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |