要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“xcms”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

xcms

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见xcms

LC/MS和GC/MS数据分析

Bioconductor版本:2.13

色谱分离和单谱质谱数据的处理和可视化框架。从AIA/ANDI NetCDF、mzXML、mzData和mzML文件导入。对高通量、非目标分析物分析的数据进行预处理。

作者:Colin A. Smith , Ralf Tautenhahn , Steffen Neumann , Paul Benton . uk>

维护者:Ralf Tautenhahn

引文(从R内,输入引用(“xcms”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“xcms”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“xcms”)

PDF FlowChart.pdf
PDF R脚本 用xcms对FTICR-MS数据进行分组
PDF R脚本 xcms安装说明
PDF R脚本 用xcms进行LC/MS预处理与分析
PDF R脚本 用xcms处理串联MS和MS$^n$数据
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews MassSpectrometry代谢组学软件
版本 1.38.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 2.14.0),方法,mzR(> = 1.1.6),BiocGenericsBiobase
进口
链接
建议 faahKOmsdatancdf,rglMassSpecWavelet(> = 1.5.2),RANNRUnit
SystemRequirements
增强了 RgraphvizKEGGSOAP,RmpiXML
URL http://metlin.scripps.edu/download/
全靠我 相机faahKOflagme
进口我 相机Risa
建议我 MassSpecWaveletmsdataRforProteomicsRMassBank
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 xcms_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 xcms_1.38.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) xcms_1.38.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/xcms/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/xcms/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心