要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tspair”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见tspair.
Bioconductor版本:2.13
这些函数计算出在两个用户指定的组之间显示出排名最大差异的一对基因。使用数据集中的一对基因,这个“最高得分对”最大化了所有基于等级的分类器的敏感性和特异性的平均值。仅根据一对基因的相对级别对样本进行分类的优点是(a)分类器比更复杂的分类方案简单得多,而且往往更易于解释;(b)如果阵列可以仅使用一对基因进行分类,基于PCR的测试可以用于样本分类。有关TSP分类器的引用,请参阅tspcalc()函数的引用。
作者:Jeffrey T. Leek
维护者:Jeffrey T. Leek
引文(从R内,输入引用(“tspair”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tspair”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“tspair”)
tsp1.pdf | ||
R脚本 | tspTutorial | |
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,微阵列,软件 |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor | BioC 2.4 (R-2.9)(7年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.10),Biobase(> =测试盒框) |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | stepwiseCM |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | tspair_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | tspair_1.20.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | tspair_1.20.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/tspair/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tspair/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |