要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“突触”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

synapter

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见synapter

无标签数据分析管道,优化识别和定量

Bioconductor版本:2.13

synapter包提供了重新分析Synapt G2质谱仪上获得的无标签蛋白质组学数据的功能。一次或几次运行,可能与额外的离子迁移分离处理,以提高识别精度,可以结合到其他定量文件,以最大限度地提高识别和定量精度。

作者:劳伦特·盖托,尼克·j·邦德,帕维尔·v·施里亚哈

维护者:Laurent Gatto

引文(从R内,输入引用(“synapter”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“突触”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“synapter”)

PDF R脚本 使用“突触”结合HDMSe/MSe数据以优化识别和定量
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学GUIMassSpectrometry蛋白质组学软件
版本 1.4.1
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R(>= 2.15),方法,MSnbase
进口 hwritertcltk,tcltk2RColorBrewer晶格qvalue跑龙套,Biobaseknitr
链接
建议 synapterdataxtable
SystemRequirements
增强了
URL http://lgatto.github.com/synapter/
全靠我 synapterdata
进口我
建议我 pRolocRforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 synapter_1.4.1.tar.gz
Windows二进制 synapter_1.4.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) synapter_1.4.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/synapter/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/synapter/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心