要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“突触”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见synapter.
Bioconductor版本:2.13
synapter包提供了重新分析Synapt G2质谱仪上获得的无标签蛋白质组学数据的功能。一次或几次运行,可能与额外的离子迁移分离处理,以提高识别精度,可以结合到其他定量文件,以最大限度地提高识别和定量精度。
作者:劳伦特·盖托,尼克·j·邦德,帕维尔·v·施里亚哈
维护者:Laurent Gatto
引文(从R内,输入引用(“synapter”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“突触”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“synapter”)
R脚本 | 使用“突触”结合HDMSe/MSe数据以优化识别和定量 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,GUI,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.4.1 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R(>= 2.15),方法,MSnbase |
进口 | hwritertcltk,tcltk2,RColorBrewer,晶格,qvalue,乘跑龙套,Biobase,knitr |
链接 | |
建议 | synapterdata,xtable |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://lgatto.github.com/synapter/ |
全靠我 | synapterdata |
进口我 | |
建议我 | pRoloc,RforProteomics |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | synapter_1.4.1.tar.gz |
Windows二进制 | synapter_1.4.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | synapter_1.4.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/synapter/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/synapter/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |