要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“supraHex”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见supraHex.
Bioconductor版本:2.13
超六边形地图是一个巨大的六边形,在二维网格上无缝地由更小的六边形组成。它的目的是训练、分析和可视化高维组学数据。supraHex能够进行基因/元基因聚类和样本相关,以及直观的可视化,以促进探索性分析。这个包的独特之处在于,用户可以同时以特定样本的方式了解自己的组学数据,但不会丢失大基因的信息。
作者:方海、朱利安·高夫
维护者:Hai Fang
引文(从R内,输入引用(“supraHex”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“supraHex”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“supraHex”)
R脚本 | supraHex用户手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,聚类,GeneExpression,软件,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.0.1),hexbin |
进口 | 网格,质量,Biobase |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://supfam.org/SUPERFAMILY/dcGO/supraHex.html |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | supraHex_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | supraHex_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | supraHex_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/supraHex/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/supraHex/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |