要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqCNA”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见seqCNA.
Bioconductor版本:2.13
高通量测序癌症数据拷贝数分析,快速总结,广泛过滤和改进归一化
作者:David Mosen-Ansorena
维护者:David Mosen-Ansorena
引文(从R内,输入引用(“seqCNA”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqCNA”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“seqCNA”)
R脚本 | seqCNA | |
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,CopyNumberVariants,遗传学,HighThroughputSequencing,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.10),很高兴(> = 2.14),doSNOW(> = 1.0.5),adehabitatLT(> = 0.3.4),seqCNA.annot(>= 0.99),方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | samtools |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | seqCNA_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | seqCNA_1.2.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | seqCNA_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/seqCNA/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqCNA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |