要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqCNA”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

seqCNA

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见seqCNA

高通量测序癌症数据拷贝数分析

Bioconductor版本:2.13

高通量测序癌症数据拷贝数分析,快速总结,广泛过滤和改进归一化

作者:David Mosen-Ansorena

维护者:David Mosen-Ansorena

引文(从R内,输入引用(“seqCNA”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqCNA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“seqCNA”)

PDF R脚本 seqCNA
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学CopyNumberVariants遗传学HighThroughputSequencing软件
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10),很高兴(> = 2.14),doSNOW(> = 1.0.5),adehabitatLT(> = 0.3.4),seqCNA.annot(>= 0.99),方法
进口
链接
建议
SystemRequirements samtools
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 seqCNA_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 seqCNA_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) seqCNA_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/seqCNA/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/seqCNA/
软件包下载报告 下载数据

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请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
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