要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rnaSeqMap”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rnaSeqMap.
Bioconductor版本:2.13
rnaSeqMap库提供了类和函数,可以一次使用多个样本中的覆盖配置文件分析rna测序数据
作者:Anna Lesniewska
维护者:Michal Okoniewski < Michal at fgcz.ethz.ch>
引文(从R内,输入引用(“rnaSeqMap”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rnaSeqMap”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“rnaSeqMap”)
R脚本 | rnaSeqMap底漆 | |
参考手册 |
biocViews | 注释,生物信息学,DifferentialExpression,GeneExpression,HighThroughputSequencing,RNAseq,ReportWriting,圣人,软件,转录,可视化 |
版本 | 2.18.0 |
在Bioconductor | BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R(>= 2.11.0),方法,Biobase,Rsamtools |
进口 | GenomicRanges,IRanges,刨边机,DESeq,DBI |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | ampliQueso |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | rnaSeqMap_2.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | rnaSeqMap_2.18.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | rnaSeqMap_2.18.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/rnaSeqMap/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaSeqMap/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |