要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“pvca”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pvca.
Bioconductor版本:2.13
该包包含通过将所有“源”拟合为随机效应,包括混合模型中的双向相互作用项(依赖于lme4包)来评估批处理源的功能,这些主成分是从原始数据相关矩阵中获得的。此包随书“微阵列实验中的批处理效应和噪声,第12章。
作者:Pierre Bushel < Bushel at niehs.nih.gov>
维护者:Jianying LI
引文(从R内,输入引用(pvca)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“pvca”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (pvca)
R脚本 | 微阵列数据的批效应估计 | |
pvcaEstimate.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | BatchEffectAssessment,生物信息学,微阵列,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(3年) |
许可证 | LGPL (>= 2.0) |
取决于 | R (>= 2.15.1) |
进口 | 矩阵,Biobase,vsn,lme4 |
链接 | |
建议 | golubEsets |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | pvca_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | pvca_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | pvca_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/pvca/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pvca/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |