要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“pvca”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

pvca

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pvca

主方差成分分析(PVCA)

Bioconductor版本:2.13

该包包含通过将所有“源”拟合为随机效应,包括混合模型中的双向相互作用项(依赖于lme4包)来评估批处理源的功能,这些主成分是从原始数据相关矩阵中获得的。此包随书“微阵列实验中的批处理效应和噪声,第12章。

作者:Pierre Bushel < Bushel at niehs.nih.gov>

维护者:Jianying LI

引文(从R内,输入引用(pvca)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“pvca”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (pvca)

PDF R脚本 微阵列数据的批效应估计
PDF pvcaEstimate.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews BatchEffectAssessment生物信息学微阵列软件
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 LGPL (>= 2.0)
取决于 R (>= 2.15.1)
进口 矩阵Biobasevsnlme4
链接
建议 golubEsets
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 pvca_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 pvca_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) pvca_1.2.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/pvca/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/pvca/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心