要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ puma”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

彪马

该软件包适用于生物导体的2.13版;对于稳定的最新版本,请参阅彪马

在微阵列分析中传播不确定性

生物导体版本:2.13

对Affymetrix Genechip数据的大多数分析都是基于表达水平的点估计值,而忽略了此类估计值的不确定性。通过传播对下游分析的不确定性,我们可以通过微阵列分析改善结果。PUMA软件包首次制造了一套不确定性传播方法,可供普通受众使用。PUMA还提供了与以前可用的不确定性传播方法相比的范围和执行速度的改进。其中包括摘要,差异表达检测,聚类和PCA方法,以及有用的绘图和数据操作函数。

作者:理查德·皮尔森(Richard D.

维护者:理查德·皮尔森(Richard Pearson)<理查德(Richard.pearson)

引用(从r内,输入引用(“ puma”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ puma”)

文档

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Browsevignettes(“ puma”)

PDF PUMA-014.pdf
PDF PUMA-015.pdf
PDF puma-016.pdf
PDF puma-022.pdf
PDF puma-023.pdf
PDF puma-024.pdf
PDF puma.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 生物信息学,,,,聚类,,,,差异性,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件
版本 3.4.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(9年)
执照 LGPL
要看 r(> = 2.10),生物酶(> = 2.5.5),副词(> = 1.23.4),图形,grdevices,方法,统计,utils,mclust
进口 生物酶(> = 2.5.5),副词(> = 1.23.4),affyio
链接
建议 Pumadata,,,,Affydata,,,,,,,,林玛,,,,注释,,,,rocr
系统要求
增强
URL http://umber.sbs.man.ac.uk/resources/puma
取决于我 Pumadata
进口我 蒂格
建议我 蒂格
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 puma_3.4.0.tar.gz
Windows二进制 puma_3.4.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) puma_3.4.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/puma/tree/release-2.13
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/puma/
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