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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“phyloseq”)

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phyloseq

这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅phyloseq

高产微生物普查数据处理和分析。

Bioconductor版本:2.13

phyloseq提供了一组类和工具来促进进口、储存、分析和微生物的人口普查数据的图形化显示。

作者:保罗·j·McMurdie < McMurdie stanford.edu >,苏珊•福尔摩斯苏珊< stat.stanford.edu >格雷戈里·斯科特乔丹和张伯伦的贡献

维护人员:Paul j . McMurdie < McMurdie stanford.edu >

从内部引用(R,回车引用(“phyloseq”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“phyloseq”)

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PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类,聚类,GeneticVariability,HighThroughputSequencing,MultipleComparisons,质量控制,软件
版本 1.6.1
Bioconductor自 BioC 2.10 (r - 2.15)(4年)
许可证 AGPL-3
取决于 R(> = 3.0.0)、方法ade4(> = 1.5.2),激情似火(> = 1.5.2)
进口 (> = 3.0.8),biom(> = 0.3.9),Biostrings(> = 2.28.0),集群(> = 1.14.4),foreach(> = 1.4),ggplot2(> = 0.9.3.1),igraph(> = 0.6.5.2),(> = 2.16.0),plyr(> = 1.8),reshape2(> = 1.2.2),尺度(> = 0.2.3),素食主义者(> = 2.0.7)
链接
建议 genefilter(> = 1.42.0),testthat(> =是0.7.1)
SystemRequirements
增强了 doParallel(> = 1.0.1)
URL http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0061217
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 phyloseq_1.6.1.tar.gz
Windows二进制 phyloseq_1.6.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) phyloseq_1.6.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/phyloseq/tree/release - 2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/phyloseq/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心