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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“phyloseq”)
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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅phyloseq。
Bioconductor版本:2.13
phyloseq提供了一组类和工具来促进进口、储存、分析和微生物的人口普查数据的图形化显示。
作者:保罗·j·McMurdie < McMurdie stanford.edu >,苏珊•福尔摩斯苏珊< stat.stanford.edu >格雷戈里·斯科特乔丹和张伯伦的贡献
维护人员:Paul j . McMurdie < McMurdie stanford.edu >
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):
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“phyloseq”)
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browseVignettes (“phyloseq”)
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,聚类,GeneticVariability,HighThroughputSequencing,MultipleComparisons,质量控制,软件 |
版本 | 1.6.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.10 (r - 2.15)(4年) |
许可证 | AGPL-3 |
取决于 | R(> = 3.0.0)、方法ade4(> = 1.5.2),激情似火(> = 1.5.2) |
进口 | 猿(> = 3.0.8),biom(> = 0.3.9),Biostrings(> = 2.28.0),集群(> = 1.14.4),foreach(> = 1.4),ggplot2(> = 0.9.3.1),igraph(> = 0.6.5.2),乘(> = 2.16.0),plyr(> = 1.8),reshape2(> = 1.2.2),尺度(> = 0.2.3),素食主义者(> = 2.0.7) |
链接 | |
建议 | genefilter(> = 1.42.0),testthat(> =是0.7.1) |
SystemRequirements | |
增强了 | doParallel(> = 1.0.1) |
URL | http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0061217 |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | phyloseq_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | phyloseq_1.6.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | phyloseq_1.6.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/phyloseq/tree/release - 2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/phyloseq/ |
包下载报告 | 下载数据 |