要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“mzR”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

mzR

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见mzR

netCDF, mzXML, mzData和mzML文件解析器(质谱数据)

Bioconductor版本:2.13

mzR为质谱数据的通用文件格式和解析器提供了统一的API。它附带了ISB随机访问解析器的包装,用于质谱mzXML, mzData和mzML文件。这个包包含ISB编写的原始代码,以及用于mzML的proteowizard库的一个子集。netCDF读取代码以前在XCMS中使用过。

作者:Bernd Fischer, Steffen Neumann, Laurent Gatto

维护者:Bernd Fischer < Bernd。fischer在embl.de>, Steffen Neumann , Laurent Gatto

引文(从R内,输入引用(“mzR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“mzR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“mzR”)

PDF R脚本 mzR, Ramp, mzXML, mzData, mzML
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学DataImport基础设施MassSpectrometry代谢组学蛋白质组学软件
版本 1.8.1
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Rcpp(>= 0.10.1),方法,utils
进口 Biobase
链接 Rcpp
建议 msdata(> = 0.1.9),RUnitfaahKO
SystemRequirements GNU make, NetCDF, zlib
增强了
URL
全靠我 MSnbaseRMassBankTargetSearchxcms
进口我
建议我 qcmetricsRforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 mzR_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 mzR_1.8.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) mzR_1.8.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/mzR/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/mzR/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心