要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“multtest”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见

基于重采样的多重假设检验

Bioconductor版本:2.13

基于非参数自举和排列重采样的多重测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制全族错误率(FWER)、广义全族错误率(gwer)、假阳性比例的尾概率(TPPFP)和假发现率(FDR)。实现了基于引导的空分布的几种选择(居中、居中和缩放、分位数转换)。可以使用单步方法和分步方法。包括基于各种t-和f -统计量(包括基于线性和生存模型回归参数的t-统计量以及基于相关参数的t-统计量)的检验。当用t-统计量探测假设时,用户也可以选择一个可能更快的零分布,它是均值为零的多元正态分布,方差协方差矩阵来自向量影响函数。结果以调整后的p值、置信区域和检验统计量截断来报告。该方法可直接应用于DNA微阵列实验中差异表达基因的鉴定。

作者:Katherine S. Pollard, Houston N. Gilbert, Yongchao Ge, Sandra Taylor, Sandrine Dudoit

维护者:Katherine S. Pollard

引文(从R内,输入引用(“相乘”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“multtest”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“相乘”)

PDF MTP.pdf
PDF MTPALL.pdf
PDF multtest.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression微阵列MultipleComparisons软件
版本 2.18.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 LGPL
取决于 R(>= 2.10),方法,Biobase
进口 生存质量, stats4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 a4BaseaCGHBicAREChIPpeakAnnoiPACKCsmartLMGenePREDAREDseqSAGxsiggeneswebbioc
进口我 ABarrayaCGHadSplitanotaChIPpeakAnnoGeneSelectorglobaltestIsoGeneGUIOCplusphyloseqREDseqRToppersynapterwebbioc
建议我 annaffyBiocCaseStudiesecolitkfactDesignGeneSelectorGOstatsGSEAlmmaigesPackMmPalateMiRNAoneChannelGUIpcot2topGOxcms
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 multtest_2.18.0.tar.gz
Windows二进制 multtest_2.18.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) multtest_2.18.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/multtest/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/multtest/
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