要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“multtest”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见乘.
Bioconductor版本:2.13
基于非参数自举和排列重采样的多重测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制全族错误率(FWER)、广义全族错误率(gwer)、假阳性比例的尾概率(TPPFP)和假发现率(FDR)。实现了基于引导的空分布的几种选择(居中、居中和缩放、分位数转换)。可以使用单步方法和分步方法。包括基于各种t-和f -统计量(包括基于线性和生存模型回归参数的t-统计量以及基于相关参数的t-统计量)的检验。当用t-统计量探测假设时,用户也可以选择一个可能更快的零分布,它是均值为零的多元正态分布,方差协方差矩阵来自向量影响函数。结果以调整后的p值、置信区域和检验统计量截断来报告。该方法可直接应用于DNA微阵列实验中差异表达基因的鉴定。
作者:Katherine S. Pollard, Houston N. Gilbert, Yongchao Ge, Sandra Taylor, Sandrine Dudoit
维护者:Katherine S. Pollard
引文(从R内,输入引用(“相乘”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“multtest”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“相乘”)
MTP.pdf | ||
MTPALL.pdf | ||
multtest.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparisons,软件 |
版本 | 2.18.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | LGPL |
取决于 | R(>= 2.10),方法,Biobase |
进口 | 生存,质量, stats4 |
链接 | |
建议 | 雪 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | a4Base,aCGH,BicARE,ChIPpeakAnno,iPAC,KCsmart,LMGene,PREDA,REDseq,SAGx,siggenes,webbioc |
进口我 | ABarray,aCGH,adSplit,anota,ChIPpeakAnno,GeneSelector,globaltest,IsoGeneGUI,OCplus,phyloseq,REDseq,RTopper,synapter,webbioc |
建议我 | annaffy,BiocCaseStudies,ecolitk,factDesign,GeneSelector,GOstats,GSEAlm,maigesPack,MmPalateMiRNA,oneChannelGUI,pcot2,topGO,xcms |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | multtest_2.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | multtest_2.18.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | multtest_2.18.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/multtest/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/multtest/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |