要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“joda”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见joda.
Bioconductor版本:2.13
包“joda”实现了名为joda的算法的三个步骤。该算法计算基因放松管制得分。对于每个基因,其解除管制得分反映了在两个不同的细胞群中,某种调控因子对该基因的扰动的影响有多强烈。该算法利用了调节器击倒表达式数据以及有关调节器所涉及的信号通路的知识(在一个简单的矩阵模型中正式化)。
作者:Ewa Szczurek
维护者:Ewa Szczurek < Szczurek at molgen.mpg.de>
引文(从R内,输入引用(“joda”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“joda”)
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browseVignettes(“joda”)
R脚本 | joda简介 | |
参考手册 |
biocViews | GraphsAndNetworks,微阵列,NetworkInference,通路,软件,统计数据 |
版本 | 1.10.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.0),bgmm,RBGL |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | joda_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | joda_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | joda_1.10.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/joda/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/joda/ |
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