要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“joda”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

joda

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见joda

利用知识量化基因调控的JODA算法

Bioconductor版本:2.13

包“joda”实现了名为joda的算法的三个步骤。该算法计算基因放松管制得分。对于每个基因,其解除管制得分反映了在两个不同的细胞群中,某种调控因子对该基因的扰动的影响有多强烈。该算法利用了调节器击倒表达式数据以及有关调节器所涉及的信号通路的知识(在一个简单的矩阵模型中正式化)。

作者:Ewa Szczurek

维护者:Ewa Szczurek < Szczurek at molgen.mpg.de>

引文(从R内,输入引用(“joda”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“joda”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“joda”)

PDF R脚本 joda简介
PDF 参考手册

细节

biocViews GraphsAndNetworks微阵列NetworkInference通路软件统计数据
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.0),bgmmRBGL
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 joda_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 joda_1.10.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) joda_1.10.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/joda/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/joda/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心