要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“imagets”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见imageHTS.
Bioconductor版本:2.13
imagets是一个R包,专门用于分析基于高通量显微镜的屏幕。该软件包提供了一个模块化和可扩展的框架来分割细胞,提取定量细胞特征,预测细胞类型和通过web界面浏览屏幕数据。imagets旨在在分布式环境中运行,提供了对远程数据的标准化访问,并促进了基于显微镜的高通量数据集的传播。
作者:Gregoire Pau, Zhang Xian, Michael Boutros, Wolfgang Huber
维护者:Gregoire Pau < Gregoire。保罗在embl.de>
引文(从R内,输入引用(“imageHTS”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“imagets”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“imageHTS”)
R脚本 | 基于imagets的高通量显微屏幕分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,CellBasedAssays,预处理,软件,可视化 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年) |
许可证 | lgpl - 2.1 |
取决于 | R (>= 2.9.0),EBImage(> = 4.3.12),cellHTS2(> = 2.10.0) |
进口 | 工具,Biobase,hwriter、方法、vsn,统计,utils,e1071 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,质量 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | phenoDist |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | imageHTS_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | imageHTS_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | imageHTS_1.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/imageHTS/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/imageHTS/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |