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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅hopach。

分层要求分区和混合(HOPACH)崩溃

Bioconductor版本:2.13

HOPACH聚类算法构建集群的层次树递归分区数据集,而排序和可能崩溃在每个水平集群。算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)标准确定树的水平,最大限度地均匀集群。它也运行树下生产最后一个元素的有序列表。非参数引导允许一个估计的概率每个元素属于每个集群(模糊聚类)。

作者:凯瑟琳·s·波拉德,范德朗Mark j . <拉恩说道:stat.berkeley.edu >和格雷格墙

维护人员:凯瑟琳·s·波拉德<凯瑟琳。波拉德:gladstone.ucsf.edu >

安装

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文档

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browseVignettes (“hopach”)

PDF		bootplot.pdf
PDF		dplot.pdf
PDF	R脚本	hopach
PDF		hopachManuscript.pdf
PDF		MSS.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,软件
版本	2.22.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.11.0),集群,Biobase、方法
进口	Biobase,集群、图形、grDevices方法、统计跑龙套,BiocGenerics
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.stat.berkeley.edu/ ~拉恩说道/http://docpollard.org/
取决于我
进口我	phenoTest
建议我	BiocCaseStudies
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	hopach_2.22.0.tar.gz
Windows二进制	hopach_2.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	hopach_2.22.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/hopach/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hopach/
包下载报告	下载数据