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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ggbio”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

ggbio

这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ggbio。

基因组数据的可视化工具。

Bioconductor版本:2.13

ggbio包扩展和专门的图形语法生物数据。图形是为了回答常见的科学问题,特别是那些经常问的高通量基因组学数据。支持所有核心Bioconductor数据结构,在适当的地方。包支持详细视图的特定基因组区域,以及全基因组概述。支持概述包括表意文字和大线性观点。高级阴谋包括序列片段长度,edge-linked间隔数据视图,不匹配的连环相撞,和几个拼接总结。

作者:腾飞阴,Dianne厨师,迈克尔·劳伦斯

维护人员:腾飞阴< yintengfei gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“ggbio”)):

安装

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PDF R脚本 0部分:介绍和快速启动
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学,基础设施,软件,可视化
版本 1.10.16
Bioconductor自 BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,ggplot2(> = 0.9.3)
进口 方法,biovizBase(> = 1.10.5),reshape2,gtable,ggplot2(> = 0.9.2),晶格,BiocGenerics,Biobase,IRanges,GenomicRanges(> = 1.13.3),GenomicFeatures,Rsamtools(> = 1.13.1),BSgenome,gridExtra,尺度,plyr,VariantAnnotation,Hmisc,rtracklayer
链接
建议 vsn,RUnit,testthat,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,affyPLM,chipseq,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,knitr
SystemRequirements
增强了
URL http://tengfei.github.com/ggbio/
取决于我 intansv
进口我 ReportingTools
建议我 gwascat,ReportingTools,SomaticCancerAlterations
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 ggbio_1.10.16.tar.gz
Windows二进制 ggbio_1.10.16.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) ggbio_1.10.16.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/ggbio/tree/release - 2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ggbio/
包下载报告 下载数据

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