# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“genefilter”)

这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genefilter。

genefilter:筛选基因微阵列实验的方法

Bioconductor版本:2.13

一些基本的功能筛选基因

作者:r .绅士,诉凯利,w·胡贝尔Hahne

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“genefilter”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“genefilter”)

PDF	R脚本	增加额外的情节:独立的过滤能力检测差异表达基因,Bourgon et al ., PNAS (2010)
PDF	R脚本	诊断为独立的过滤
PDF	R脚本	如何找到类似于指定基因的表达谱的基因吗
PDF	R脚本	使用genefilter函数过滤基因微阵列数据集
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,微阵列,软件
版本	1.44.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	AnnotationDbi,注释(> = 1.13.7),Biobase(> = 1.99.10)、图形的方法,统计数据,生存
链接
建议	Biobase(> = 1.99.10),类,hgu95av2.db、方法、tkWidgets,所有,中华民国,DESeq,pasilla
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	a4Base,Agi4x44PreProcess,ampliQueso,cellHTS,cellHTS2,魅力,CNTools,GeneMeta,Hiiragi2013,MLInterfaces,simpleaffy
进口我	affycoretools,affyQCReport,annmap,arrayQualityMetrics,类别,DESeq,DESeq2,eisa,gCMAP,GGBase,GSRI,methyAnalysis,methylumi,minfi,phenoTest,林格,RNAinteractMAPK,simpleaffy,tilingArray,XDE
建议我	AffyExpress,注释,ArrayTools,BiocCaseStudies,生命网络,类别,categoryCompare,clusterStab,codelink,curatedBladderData,curatedOvarianData,雌激素,factDesign,ffpe,ffpeExampleData,gageData,GOstats,GSEAlm,GSVA,logicFS,光民,MAQCsubset,MCRestimate,益生元,oneChannelGUI,phyloseq,pvac,qpgraph,rheumaticConditionWOLLBOLD,rtracklayer,siggenes,SSPA,topGO,VanillaICE,XDE
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	genefilter_1.44.0.tar.gz
Windows二进制	genefilter_1.44.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	genefilter_1.44.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/genefilter/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
包下载报告	下载数据