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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅刨边机。

数字在R基因表达数据的实证分析

Bioconductor版本:2.13

微分表达式RNA-seq和数字基因表达谱分析与生物复制。使用经验贝叶斯估计和准确的测试基于负二项分布。也用于微分信号分析与其他类型公司的统计数据。

作者:<马克马克。罗宾逊。在imls.uzh罗宾逊。ch >,戴维斯麦卡锡在wehi.edu.au > < dmccarthy Yunshun陈wehi.edu.au > <尝试,亚伦Lun wehi.edu.au > <阿伦,戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

维护人员:马克·罗宾逊<马克。在imls.uzh罗宾逊。ch >,戴维斯麦卡锡在wehi.edu.au > < dmccarthy Yunshun陈wehi.edu.au > <尝试,戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

安装

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文档

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browseVignettes(磨边机)

PDF	R脚本	磨边机装饰图案
PDF		edgeRUsersGuide.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,ChIPseq,DifferentialExpression,HighThroughputSequencing,RNAseq,圣人,软件
版本	3.4.2
Bioconductor自	BioC 2.3 (r - 2.8)(7.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 2.15.0)、方法limma
进口
链接
建议	质量,statmod样条函数,locfit,KernSmooth
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	DBChIP,easyRNASeq,外套,methylMnM,移行细胞癌,tRanslatome
进口我	ampliQueso,ArrayExpressHTS,DiffBind,DSS,HTSFilter,MEDIPS,msmsTests,Repitools,ReportingTools,rnaSeqMap,tweeDEseq
建议我	baySeq,BitSeq,clonotypeR,cqn,EDASeq,计,GenomicRanges,goseq,GSVA,leeBamViews,oneChannelGUI,pasilla,SSPA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	edgeR_3.4.2.tar.gz
Windows二进制	edgeR_3.4.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	edgeR_3.4.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/edger/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/edgeR/
包下载报告	下载数据