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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅dyebias。

GASSCO方法为纠正slide-dependent gene-specific染料的偏见

Bioconductor版本:2.13

很多双色杂交过程受到一种染料gene-specific和slide-specific偏见。前者取决于核苷酸用于标签的内容;后者取决于标签百分比。slide-dependency至今没有公认,解决人工制品是不可能的。鉴于dye-swapped双杂交过程的一个合理的数量,或相同的和相同的杂交过程的基因和slide-biases使用GASSCO方法可以估计和修正(Margaritis et al .,摩尔系统。生物5:266 (2009),doi: 10.1038 / msb.2009.21)

作者:菲利普Lijnzaad Thanasis Margaritis

维护人员:菲利普Lijnzaad < p。在umcutrecht.nl lijnzaad >

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browseVignettes (“dyebias”)

PDF	R脚本	染料偏差纠正
PDF		dyebiasCompleteVignette.pdf
PDF		gassco.pdf
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 1.4.1),marray,Biobase
进口
链接
建议	limma,转换,GEOquery,dyebiasexamples、方法
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad
取决于我
进口我
建议我	dyebiasexamples
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	dyebias_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	dyebias_1.20.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	dyebias_1.20.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/dyebias/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/
包下载报告	下载数据