安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“dyebias”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

dyebias

这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅dyebias

GASSCO方法为纠正slide-dependent gene-specific染料的偏见

Bioconductor版本:2.13

很多双色杂交过程受到一种染料gene-specific和slide-specific偏见。前者取决于核苷酸用于标签的内容;后者取决于标签百分比。slide-dependency至今没有公认,解决人工制品是不可能的。鉴于dye-swapped双杂交过程的一个合理的数量,或相同的和相同的杂交过程的基因和slide-biases使用GASSCO方法可以估计和修正(Margaritis et al .,摩尔系统。生物5:266 (2009),doi: 10.1038 / msb.2009.21)

作者:菲利普Lijnzaad Thanasis Margaritis

维护人员:菲利普Lijnzaad < p。在umcutrecht.nl lijnzaad >

从内部引用(R,回车引用(“dyebias”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“dyebias”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“dyebias”)

PDF R脚本 染料偏差纠正
PDF dyebiasCompleteVignette.pdf
PDF gassco.pdf
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews 微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 2.4 (r - 2.9)(7年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 1.4.1),marray,Biobase
进口
链接
建议 limma,转换,GEOquery,dyebiasexamples、方法
SystemRequirements
增强了
URL http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad
取决于我
进口我
建议我 dyebiasexamples
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 dyebias_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 dyebias_1.20.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) dyebias_1.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/dyebias/tree/release - 2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/
包下载报告 下载数据

文档»

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支持»

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心