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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ddCt。

ddCt算法分析定量实时PCR(存在)

Bioconductor版本:2.13

Delta-Delta-Ct (ddCt)算法是一种近似方法来确定相对基因表达定量实时PCR(存在)的实验。与其他方法相比,它不需要为每个primer-target双标准曲线,因此减少工作负荷,但返回足够精确的结果只要扩增效率的假设。ddCt包实现了管道收集,分析和可视化中存在的结果,例如来自TaqMan SDM软件,主要使用ddCt方法。管道可以通过在命令行或脚本API调用由S4-Classes、方法和功能。

作者:大卫•张Jitao鲁道夫Biczok和马库斯Ruschhaupt

维修工:Jitao大卫张< jitao_david。张在roche.com >

安装

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browseVignettes (ddCt)

PDF	R脚本	rt - pcr分析数据与ddCt中的端到端脚本包
PDF	R脚本	如何应用ddCt方法
PDF	R脚本	介绍ddCt方法中存在数据分析:背景、算法和例子
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,MicrotitrePlateAssay,软件,qPCR
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(6.5年)
许可证	LGPL-3
取决于	R (> = tripwire),Biobase(> = 1.10.0),RColorBrewer(0.1 > = 3),xtable,晶格、方法
进口
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
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取决于我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ddCt_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	ddCt_1.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ddCt_1.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/ddct/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ddCt/
包下载报告	下载数据