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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅customProDB。

从门店数据生成定制的蛋白质数据库,重点RNA-Seq数据,为蛋白质组学搜索。

Bioconductor版本:2.13

蛋白质组学从RNA-Seq生成定制的蛋白质序列数据库数据搜索

作者:小菁王

维护人员:小菁王<小菁。王在vanderbilt.edu >

安装

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PDF	R脚本	介绍customProDB
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.0.1),IRanges,AnnotationDbi,biomaRt
进口	Rsamtools(> = 1.10.2),Biostrings(> = 2.26.3之前),IRanges,GenomicRanges(> = 1.13.18),GenomicFeatures(> = 1.13.15),biomaRt(> = 2.17.1),stringr,RCurl,plyr,VariantAnnotation(> = 1.7.28),rtracklayer,RSQLite,AnnotationDbi
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	customProDB_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	customProDB_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	customProDB_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/customprodb/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/customProDB/
包下载报告	下载数据