安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“cn.farms”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

cn.farms

这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cn.farms

cn.farms- factor analysis for copy number estimation

Bioconductor版本:2.13

这个包实现了cn。农场拷贝数变异(CNV)算法分析。cn。农场可以分析最常见Affymetrix (250 k-snp6.0)数组类型,支持使用雪和ff高性能计算。

作者:Andreas Mitterecker Djork-Arne Clevert

维护人员:Andreas Mitterecker < Mitterecker在bioinf.jku.at >

从内部引用(R,回车引用(“cn.farms”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“cn.farms”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cn.farms”)

PDF R脚本 cn.farms: Manual for the R package
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学,CopyNumberVariants,微阵列,软件
版本 1.10.0
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证 LGPL (> = 2.0)
取决于 R (> = 2.11),Biobase、方法、ff,oligoClasses,
进口 BiocGenerics,DBI,affxparser,益生元,DNAcopy,preprocessCore,晶格
链接
建议 pd.mapping250k.sty,pd.mapping250k.nsp,pd.genomewidesnp.5,pd.genomewidesnp.6
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 cn.farms_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 cn.farms_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) cn.farms_1.10.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/cn.farms/tree/release - 2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cn.farms/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心