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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅clusterProfiler。

统计分析和visulization基因和基因的功能配置集群

Bioconductor版本:2.13

包实现方法分析和可视化功能配置(去和KEGG)的基因和基因集群。

作者:李亘Guangchuang Yu王

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“clusterProfiler”)

PDF	R脚本	介绍clusterProfiler
PDF		clusterProfiler_for_unsupported_organisms.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,去,GeneSetEnrichment,MultipleComparisons,通路,软件,可视化
版本	1.10.1
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),ggplot2
进口	方法、stats4DBI,plyr,AnnotationDbi,GO.db,KEGG.db,org.Hs.eg.db,剂量,GOSemSim
链接
建议	ReactomePA,pathview,knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://online.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/omi.2011.0118
取决于我
进口我
建议我	剂量,GOSemSim,ReactomePA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	clusterProfiler_1.10.1.tar.gz
Windows二进制	clusterProfiler_1.10.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	clusterProfiler_1.10.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/clusterprofiler/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/clusterProfiler/
包下载报告	下载数据