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此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见限幅器。

利用路径拓扑进行基因集分析

Bioconductor版本:2.13

Clipper是一个用于拓扑基因集分析的软件包。它实现了一种基于将图分解为连接树的两步经验方法来重建最相关的信号路径。在第一步中，裁剪器根据对路径拓扑图的均值和集中矩阵的统计检验来选择显著路径。然后，它“剪辑”整个通路，识别与特定表型有最大关联的信号通路。

作者:Paolo Martini < Paolo。Cavei在gmail.com>，Gabriele Sales , Chiara Romualdi

维护者:Paolo Martini < Paolo。Cavei在gmail.com>

安装

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文档

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PDF	R脚本	限幅器
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件
版本	1.2.3
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (>= 2.15.0)，矩阵，图
进口	方法,Biobase，igraph，gRbase(> = 1.6.6),qpgraph，KEGGgraph，corpcor，RBGL，Rcpp
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，RCytoscape(> = 1.6.3),石墨，所有，hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	石墨
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	clipper_1.2.3.tar.gz
Windows二进制	clipper_1.2.3.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	clipper_1.2.3.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/clipper/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/clipper/
软件包下载报告	下载数据