要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“魅力”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见魅力.
Bioconductor版本:2.13
该软件包实现了使用Nimblegen微阵列和McrBC协议生成的DNA甲基化数据的分析工具。它可以在样品之间找到不同的甲基化区域,计算甲基化估计的百分比,并包括阵列质量评估工具。
作者:Martin Aryee, Peter Murakami, Harris Jaffee, Rafael Irizarry
维护者:Peter Murakami
引文(从R内,输入引用(“魅力”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“魅力”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“魅力”)
R脚本 | 魅力装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,DNAMethylation,微阵列,软件 |
版本 | 2.8.0 |
在Bioconductor | BioC 2.6 (R-2.11)(6年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.14.0),Biobase,SQN,字段,RColorBrewer,genefilter |
进口 | BSgenome,Biobase,益生元(> = 1.11.31),oligoClasses(> = 1.17.39),ff,preprocessCore,方法,统计,Biostrings,IRanges,siggenes,nor1mix,gtools, grDevices,图形,utils,limma平行,股东价值分析(> = 3.1.2) |
链接 | |
建议 | charmData,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,corpcor |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | charmData |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | charm_2.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | charm_2.8.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | charm_2.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/charm/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/charm/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |