##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("categoryCompare")

此包适用于Bioconductor的2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见categoryCompare．

使用特征注释的高通量实验的元分析

Bioconductor版本:2.13

计算两个(或多个)特征(即基因)列表中的每个特征(即基因)列表中的显著注释(类别)，确定注释之间的重叠，并返回有关显著注释的图形和表格数据，以及发现哪些特征列表组合的注释是显著的。通过使用RCytoscape(强烈建议使用)可以促进交互式探索。

作者:Robert M. Flight

维护人员:Robert M. Flight

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("categoryCompare")

文档

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browseVignettes(“categoryCompare”)

PDF		categoryCompare:使用基因注释的高通量数据元分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，生物信息学，去，GeneExpression，MultipleComparisons，通路，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor公司	BioC 2.10 (R-2.15)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.10)，Biobase，BiocGenerics
进口	AnnotationDbi，hwriter，GSEABase，类别，GOstats，注释，色彩，图，RCytoscape(> = 1.5.11)
链接
建议	方法,GO.db，KEGG.db，雌激素，org.Hs.eg.db，hgu95av2.db，limma，affy，genefilter
SystemRequirements	Cytoscape(>= 2.8.0)(如果用于结果的可视化，强烈建议)，CytoscapeRPC插件(>= 1.8)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	categoryCompare_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	categoryCompare_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	categoryCompare_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/categoryCompare/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/categoryCompare/
软件包下载报告	下载数据