要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ biovizbase”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Biovizbase

该软件包适用于生物导体的2.13版;对于稳定的最新版本,请参阅Biovizbase

可视化基因组数据的基本图形实用程序。

生物导体版本:2.13

BiovizBase软件包旨在为基因组数据提供一组实用程序,配色方案和约定。它是用于生物数据可视化的各种高级包装的基础。这节省了发展努力并鼓励一致性。

作者:Tengfei Yin,Michael Lawrence,Dianne Cook

维护者:tengfei yin

引用(从r内,输入引用(“ Biovizbase”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ biovizbase”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Biovizbase”)

PDF R脚本 Biovizbase简介
PDF 介绍single.pdf
PDF 介绍性散布。pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物信息学,,,,基础设施,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化
版本 1.10.8
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.10),方法
进口 方法,grdevices,统计,,,,,HMISC,,,,rcolorbrewer,,,,Dichromat,,,,生物基因,,,,iranges,,,,基因组机(> = 1.13.3),生物弦,,,,rsamtools(> = 1.13.1),GenomicFeatures
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,BSGENOME,,,,rtracklayer
系统要求
增强
URL
取决于我 QRQC
进口我 GGBIO,,,,GVIZ,,,,QRQC
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 biovizbase_1.10.8.tar.gz
Windows二进制 biovizbase_1.10.8.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) biovizbase_1.10.8.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/biovizbase/tree/release-2.13
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biovizbase/
软件包下载报告 下载统计

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