要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ biovizbase”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的2.13版;对于稳定的最新版本,请参阅Biovizbase。
生物导体版本:2.13
BiovizBase软件包旨在为基因组数据提供一组实用程序,配色方案和约定。它是用于生物数据可视化的各种高级包装的基础。这节省了发展努力并鼓励一致性。
作者:Tengfei Yin,Michael Lawrence,Dianne Cook
维护者:tengfei yin
引用(从r内,输入引用(“ Biovizbase”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Biovizbase”)
R脚本 | Biovizbase简介 | |
介绍single.pdf | ||
介绍性散布。pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物信息学,,,,基础设施,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.10.8 |
在生物导体中 | Bioc 2.9(R-2.14)(4。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 2.10),方法 |
进口 | 方法,grdevices,统计,秤,,,,HMISC,,,,rcolorbrewer,,,,Dichromat,,,,生物基因,,,,iranges,,,,基因组机(> = 1.13.3),生物弦,,,,rsamtools(> = 1.13.1),GenomicFeatures |
链接 | |
建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,BSGENOME,,,,rtracklayer |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | QRQC |
进口我 | GGBIO,,,,GVIZ,,,,QRQC |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | biovizbase_1.10.8.tar.gz |
Windows二进制 | biovizbase_1.10.8.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | biovizbase_1.10.8.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/biovizbase/tree/release-2.13 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biovizbase/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |