##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite(" bioart ")

此包适用于Bioconductor的2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见biomaRt．

生物艺术数据库的接口(例如:ensemble, COSMIC,Wormbase和Gramene)

Bioconductor版本:2.13

近年来，在公共数据储存库中已经有了大量的生物数据。要进行全面的生物信息学数据分析，需要方便地获取这些有价值的数据资源并与数据分析进行紧密集成。biomaRt为实现biomaRt软件套件(http://www.biomart.org)的日益增长的数据库集合提供了一个接口。该包支持以统一的方式检索大量数据，而不需要知道底层数据库模式或编写复杂的SQL查询。BioMart数据库的例子有:ensemble bl, COSMIC, Uniprot, HGNC, Gramene, Wormbase和dbSNP映射到ensemble bl。这些主要数据库使生物艺术用户可以直接访问不同的数据集，并实现从基因注释到数据库挖掘的广泛的强大在线查询。

作者:Steffen Durinck ， Wolfgang Huber < Huber at ebi.ac.uk>

维护人员:Steffen Durinck

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite(" bioart ")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“biomaRt”)

PDF	R脚本	生物艺术用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释，软件
版本	2.18.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法
进口	跑龙套,XML，RCurl
链接
建议	注释
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	ChIPpeakAnno，customProDB，dagLogo，domainsignatures，DrugVsDisease，easyRNASeq，Fletcher2013b，genefu，GenomeGraphs，MineICA，PSICQUIC，Roleswitch，SeqGSEA，shinyTANDEM，VegaMC
进口我	affycoretools，ArrayExpressHTS，ChIPpeakAnno，cobindR，customProDB，DEXSeq，GenomicFeatures，Gviz，HTSanalyzeR，IdMappingRetrieval，MEDIPS，methyAnalysis，phenoTest，R453Plus1Toolbox，RNAither
建议我	BiocCaseStudies，ccTutorial，GeneAnswers，GenomicFeatures，Genominator，Gviz，等压线，leeBamViews，时间的，MineICA，海市蜃楼，oneChannelGUI，钢琴，Rcade，RforProteomics，RIPSeeker，RnaSeqTutorial，rTANDEM，rTRM，ShortRead，SIM卡
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	biomaRt_2.18.0.tar.gz
Windows二进制	biomaRt_2.18.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	biomaRt_2.18.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/biomaRt/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biomaRt/
包下载报告	下载数据