要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

beadarray

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见beadarray

Illumina BeadArray数据的质量评估和底层分析

Bioconductor版本:2.13

该包能够读取由BeadScan输出的串珠级数据(原始tiff和文本文件)以及来自BeadStudio的串珠摘要数据。提供了质量评价和低层次分析的方法。

作者:马克·邓宁,迈克·史密斯,乔纳森·凯恩斯,安迪·林奇,马特·里奇

维护者:Mark Dunning

引文(从R内,输入引用(“beadarray”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“beadarray”)

PDF R脚本 beadarray.pdf
PDF R脚本 beadlevel.pdf
PDF R脚本 beadsummary.pdf
PDF R脚本 ImageProcessing.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列OneChannel预处理质量控制软件
版本 2.12.0
在Bioconductor BioC 1.8 (R-2.3)(10年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.13.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(>= 2.17.8),方法,ggplot2
进口 BeadDataPackRlimmaAnnotationDbistats4,BiocGenericsreshape2
链接
建议 光民vsnaffyhwriterbeadarrayExampleDatailluminaHumanv3.dbgridExtra
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 beadarrayExampleData
进口我 arrayQualityMetricsBeadArrayUseCasesepigenomix
建议我 beadarraySNP光民
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 beadarray_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 beadarray_2.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) beadarray_2.12.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/beadarray/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心