要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见beadarray.
Bioconductor版本:2.13
该包能够读取由BeadScan输出的串珠级数据(原始tiff和文本文件)以及来自BeadStudio的串珠摘要数据。提供了质量评价和低层次分析的方法。
作者:马克·邓宁,迈克·史密斯,乔纳森·凯恩斯,安迪·林奇,马特·里奇
维护者:Mark Dunning
引文(从R内,输入引用(“beadarray”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“beadarray”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“beadarray”)
R脚本 | beadarray.pdf | |
R脚本 | beadlevel.pdf | |
R脚本 | beadsummary.pdf | |
R脚本 | ImageProcessing.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,软件 |
版本 | 2.12.0 |
在Bioconductor | BioC 1.8 (R-2.3)(10年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.13.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(>= 2.17.8),方法,ggplot2 |
进口 | BeadDataPackR,limma,AnnotationDbistats4,BiocGenerics,reshape2 |
链接 | |
建议 | 光民,vsn,affy,hwriter,beadarrayExampleData,illuminaHumanv3.db,gridExtra |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | beadarrayExampleData |
进口我 | arrayQualityMetrics,BeadArrayUseCases,epigenomix |
建议我 | beadarraySNP,光民 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | beadarray_2.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | beadarray_2.12.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | beadarray_2.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/beadarray/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |