要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“arrayQualityMetrics”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

arrayQualityMetrics

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见arrayQualityMetrics

微阵列数据集的质量度量

Bioconductor版本:2.13

这个包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)中的数据生成微阵列质量度量报告。报告包含一般和特定于平台的部分。支持单色和双色阵列平台。

作者:奥黛丽·考夫曼,沃尔夫冈·胡贝尔

维护者:Audrey Kauffmann

引文(从R内,输入引用(“arrayQualityMetrics”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“arrayQualityMetrics”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)

PDF R脚本 高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理
PDF R脚本 简介:使用arrayQualityMetrics进行微阵列质量评估
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列OneChannel质量控制ReportWriting软件TwoChannel
版本 3.18.0
在Bioconductor BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于
进口 affyaffyPLM(> = 1.27.3),beadarrayBiobase开罗(> = 1.4 6),genefilter,图形,grDevices,网格,Hmischwriter晶格latticeExtralimma、方法、RColorBrewersetRNGsimpleaffy,属性,SVGAnnotation (>= 0.9-0), utils,vsn(> = 3.23.3),XML
链接
建议 ALLMLL亚兰
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 arrayQualityMetrics_3.18.0.tar.gz
Windows二进制 arrayQualityMetrics_3.18.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) arrayQualityMetrics_3.18.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/arrayQualityMetrics/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心