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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅annmap。

基因组注释和可视化包属于Affymetrix数组和门店分析。

Bioconductor版本:2.13

annmap提供注释映射Affymetrix外显子数组和坐标查询支持深度测序数据分析。数据库访问是隐藏在API提供了一组功能,比如genesInRange (), geneToExon (), exonDetails()等函数来绘制基因结构和BAM文件数据也提供。基础数据来自运用。

作者:蒂姆·耶茨< tyates在picr.man.ac.uk >

维护人员:蒂姆·耶茨< tyates在picr.man.ac.uk >

安装

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文档

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browseVignettes (“annmap”)

PDF	R脚本	annmap安装指令
PDF	R脚本	annmap底漆
PDF	R脚本	Annmap Cookbook
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,生物信息学,微阵列,OneChannel,ReportWriting,软件,转录,可视化
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 2.15.0)、方法GenomicRanges
进口	DBI,RMySQL(0.6 > = 0),消化,Biobase、网格晶格,Rsamtools,genefilter,IRanges,BiocGenerics
链接
建议	RUnit,rjson
SystemRequirements
增强了
URL	http://annmap.picr.man.ac.uk
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	annmap_1.4.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	annmap_1.4.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/annmap/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/annmap/
包下载报告	下载数据