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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affxparser。

Affymetrix SDK文件解析

Bioconductor版本:2.13

包解析Affymetrix文件(CDF,玻璃纸,共和人民党,BPMAP, BAR)。它提供了快速和内存高效方法解析Affymetrix文件使用Affymetrix融合的SDK。ASCII和基于二进制的文件支持。目前,有方法阅读芯片定义文件(CDF)和细胞强度文件(移动电话)。这些文件可以读取全部或部分。例如,探针信号从几probesets可以很快从一个组移动电话文件提取到一个方便的列表结构。

作者:亨利克·本特松(aut),布拉德(aut),罗伯特先生[所有],Kasper丹尼尔·汉森(aut (cre),马丁·摩根(施)

维修工:Kasper丹尼尔·汉森< khansen jhsph.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,软件
版本	1.34.2
Bioconductor自	BioC 1.7 (r - 2.2)(10.5年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.6.0)
进口
链接
建议	R.utils(> = 1.29.8),AffymetrixDataTestFiles
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	斜体,pdInfoBuilder,rMAT,斯塔尔
进口我	affyILM,AffyTiling,cn.farms,GeneRegionScan,斜体,益生元,rMAT
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	affxparser_1.34.2.tar.gz
Windows二进制	affxparser_1.34.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	affxparser_1.34.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/affxparser/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affxparser/
包下载报告	下载数据