要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“adSplit”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见adSplit.
Bioconductor版本:2.13
该包根据功能注释实现了微阵列基因表达谱的聚类。对于注释的每个术语基因,计算分成两个子类,并确定支持基因集的显著性。
作者:Claudio Lottaz, Joern Toedling
维护者:Claudio Lottaz
引文(从R内,输入引用(“adSplit”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“adSplit”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“adSplit”)
R脚本 | 注解驱动的集群 | |
bcb_logo.pdf | ||
minerva_bcb.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,聚类,微阵列,软件 |
版本 | 1.32.0 |
在Bioconductor | BioC 1.8 (R-2.3)(10年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 2.1.0),方法(>= 2.1.0) |
进口 | AnnotationDbi,Biobase(> = 1.5.12),集群(> = 1.9.1),GO.db(>= 1.8.1),图形,grDevices,KEGG.db(>= 1.8.1),方法乘(>= 1.6.0), stats (>= 2.1.0) |
链接 | |
建议 | golubEsets(> = 1.0),vsn(> = 1.5.0),hu6800.db(> = 1.8.1) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://compdiag.molgen.mpg.de/software/index.shtml |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | adSplit_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | adSplit_1.32.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | adSplit_1.32.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/adSplit/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/adSplit/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |