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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅VariantTools。

工具使用的遗传变异

Bioconductor版本:2.13

检测工具、过滤、调用、比较和策划变体。

作者:迈克尔·劳伦斯,耶利米Degenhardt,罗伯特先生

维护人员:迈克尔·劳伦斯< michafla gene.com >

安装

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文档

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PDF	R脚本	介绍VariantTools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,HighThroughputSequencing,软件
版本	1.4.5
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	IRanges(> = 1.19.34),GenomicRanges(> = 1.13.43),VariantAnnotation(> = 1.7.35)方法
进口	IRanges,Rsamtools(> = 1.11.10),GenomicRanges,BiocGenerics,Biostrings平行,gmapR(> = 1.3.8),GenomicFeatures,VariantAnnotation、方法、矩阵,rtracklayer,BiocParallel
链接
建议	RUnit,LungCancerLines(> = 0.0.6),RBGL
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	HTSeqGenie
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	VariantTools_1.4.5.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/varianttools/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/VariantTools/
包下载报告	下载数据