要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TargetScore”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TargetScore.
Bioconductor版本:2.13
通过概率模拟microRNA过表达折叠变化的可能性和基于序列的分数,推断microRNA目标的后验分布。采用变向贝叶斯高斯混合模型(VB-GMM)记录折叠变化和序列分数,得到潜在变量作为miRNA靶标的后验。最终的targetScore计算为sigmoid转换的折叠变化,由所有特征的目标组件的平均后视进行加权。
作者:李越
维护者:Yue Li
引文(从R内,输入引用(“TargetScore”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TargetScore”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TargetScore”)
R脚本 | TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,微 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | pracma,矩阵 |
进口 | |
链接 | |
建议 | TargetScoreData,gplots,Biobase,GEOquery |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | TargetScoreData |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | TargetScore_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | TargetScore_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | TargetScore_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/TargetScore/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TargetScore/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |