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剪接图
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该软件包适用于生物导体的2.13版；对于稳定的最新版本，请参阅剪接图。
创建，操纵，可视化剪接图并分配RNA-Seq读取给它们
生物导体版本：2.13
该软件包允许用户根据给定生物体的基因模型创建，操纵和可视化剪接图及其气泡。此外，它允许用户将RNA-Seq读取为一组剪接图的边缘，并以不同的方式进行汇总。
作者：D。Bindreither，M。Carlson，M。Morgan，H。页面
维护者：H。页面
引用（从r内，输入引用（“剪接图”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ plaplicinggraphs”）
文档
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browsevignettes（“剪接图”）
| R脚本 | 剪接图和RNA-seq数据 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，datarepresentation，，，，基因表达，，，，遗传学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（3年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 生物基因，，，，iranges（> = 1.17.43），基因组机（> = 1.13.5），GenomicFeatures，，，，rgraphviz（> = 2.3.7） |
| 进口 | 方法，utils，Igraph，，，，生物基因，，，，iranges，，，，基因组机，，，，GenomicFeatures，，，，图形，，，，rgraphviz |
| 链接 | |
| 建议 | Igraph，，，，GVIZ，，，，rsamtools，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14，，，，运行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | SplicingGraphs_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SplicingGraphs_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | SplicingGraphs_1.2.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/splicinggraphs/tree/release-2.13 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/splicinggraphs/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
