安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SpeCond”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SpeCond。
Bioconductor版本:2.13
这个包执行基因表达数据分析来检测condition-specific基因。这样明显上升或下调基因在一个小数量的条件。它是通过拟合的混合正态分布表达式的值。条件可以是环境条件,不同组织、器官或任何其他来源,你想比较基因表达。
作者:佛罗伦萨卡瓦利
维护人员:佛罗伦萨卡瓦利<佛罗伦萨在ebi.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“SpeCond”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SpeCond”)
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browseVignettes (“SpeCond”)
R脚本 | SpeCond | |
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,聚类,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparisons,ReportWriting,软件 |
版本 | 1.16.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(6.5年) |
许可证 | LGPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.10.0),mclust(> = 3.3.1),Biobase(> = 1.15.13),字段,hwriter(> = 1.1),RColorBrewer、方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | SpeCond_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | SpeCond_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SpeCond_1.16.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/specond/tree/release - 2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SpeCond/ |
包下载报告 | 下载数据 |