##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ShortRead”)

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ShortRead．

用于高通量短读测序数据的类和方法。

Bioconductor版本:2.13

用于表示高通量、短读测序数据的基类、函数和方法。

作者:马丁·摩根，迈克尔·劳伦斯，西蒙·安德斯

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ShortRead”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ShortRead”)

PDF	R脚本	ShortRead简介
PDF		ShortRead_and_HilbertVis.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，HighThroughputSequencing，质量控制，测序，软件
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 2.3 (R-2.8)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.19.34),GenomicRanges(> = 1.13.43),Biostrings(> = 2.29.18),晶格，Rsamtools(> = 1.13.1)
进口	Biobase，hwriter，zlibbioc，latticeExtra
链接	IRanges，XVector，Biostrings
建议	biomaRt，RUnit，GenomicFeatures，yeastNagalakshmi
SystemRequirements
增强了	Rmpi、并行
URL
全靠我	chipseq，ChIPseqR，easyRNASeq，EatonEtAlChIPseq，EDASeq，girafe，HTSeqGenie，诊断，OTUbase，Rolexa，rSFFreader，segmentSeq
进口我	ArrayExpressHTS，chipseq，ChIPseqR，ChIPsim，诊断，OTUbase，QuasR，R453Plus1Toolbox，Rolexa，rSFFreader，RSVSim
建议我	CSAR，DBChIP，Genominator，图片，平，R453Plus1Toolbox，Repitools，RnaSeqTutorial，Rsamtools，yeastRNASeq
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	ShortRead_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	ShortRead_1.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ShortRead_1.20.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/ShortRead/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ShortRead/
软件包下载报告	下载数据