要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“seqgsea”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SEQGSEA

该套餐适用于生物体的2.13版;对于稳定的最新版本版本,请参阅SEQGSEA

RNA-SEQ数据的基因设定浓缩分析(GSEA):整合差异表达和拼接

生物导体版本:2.13

该包装通常通过整合差异表达和剪接来提供基因对高通量RNA-SEQ数据的富集分析的方法。它使用负二项式分布来模拟读数数据,用于测序偏差和生物变化。基于置换测试,还可以分别达到统计显着性分别来实现差异表达和剪接。

作者:xi wang

维护者:xi wang

引文(从R内,输入引文(“SEQGSEA”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“seqgsea”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“SEQGSEA”)

PDF. r script. 基因将RNA-SEQ数据与SEQGSEA包装的浓缩分析
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 不同的亚兴基因表达GenesetenRichment.Highthrougputsequencing.rnaseq.软件
版本 1.2.1
在生物导体中以来 BIOC 2.12(R-3.0)(3年)
执照 GPL(> = 3)
依靠 BioBase.生物根系DESEQ.生物雕Foreach.
进口 方法,多达齐全
链接到
建议
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 seqgsea_1.2.1.tar.gz.
Windows二进制文件 seqgsea_1.2.1.zip.
Mac OS x 10.6(雪豹) seqgsea_1.2.1.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondion-mirror/seqgsea/tree/release-2.13
包短网址 http://biocidodder.org/packages/seqgsea/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网
Fred Hutchinson癌症研究中心