安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SeqArray”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SeqArray。
Bioconductor版本:2.13
大数据管理的全基因组变异使用CoreArray库:基因型数据和注释存储在一个array-oriented方式,提供高效的访问使用R基因变异的语言。
作者:Xiuwen郑,斯蒂芬妮·m·Gogarten凯西劳里
维护人员:Xiuwen郑< zhengx u.washington.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SeqArray”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SeqArray”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SeqArray”)
SeqArray-JSM2013.pdf | ||
R脚本 | SeqArray: R / Bioconductor包大数据管理的全基因组测序变体 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,遗传学,基础设施,测序,软件 |
版本 | 1.2.1 " |
Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(3年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | gdsfmt (> = 1.0.0) |
进口 | 方法,Biostrings,GenomicRanges,IRanges,VariantAnnotation |
链接 | |
建议 | 平行,雪,BiocGenerics,RUnit,Rcpp |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://corearray.sourceforge.net/tutorials/SeqArray/ |
取决于我 | SeqVarTools |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | SeqArray_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | SeqArray_1.2.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SeqArray_1.2.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/seqarray/tree/release - 2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqArray/ |
包下载报告 | 下载数据 |