要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPchip”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SNPchip

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPchip

副本编号更改的可视化

Bioconductor版本:2.13

这个包定义了可视化高通量基因组数据的方法

作者:Robert Scharpf 和Ingo Ruczinski

维护者:Robert Scharpf

引文(从R内,输入引用(“SNPchip”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPchip”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SNPchip”)

PDF R脚本 绘制染色体组型
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariantsGeneticVariability单核苷酸多态性软件可视化
版本 2.8.0
在Bioconductor BioC 2.0 (R-2.5)(9年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.14.0)
进口 图形,晶格、网格foreach, utils,方法,oligoClasses(> = 1.21.12),BiobaseGenomicRanges
链接
建议 crlmm(> = 1.17.14),IRangesRUnit
SystemRequirements
增强了 doSNOWVanillaICE(> = 1.21.24),RColorBrewer
URL http://www.biostat.jhsph.edu/~iruczins/software/snpchip.html
全靠我 mBPCR
进口我 crlmmphenoTest
建议我 类别MinimumDistanceoligoClassesVanillaICE
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 SNPchip_2.8.0.tar.gz
Windows二进制 SNPchip_2.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) SNPchip_2.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/SNPchip/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心