安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“红”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅红色的。
Bioconductor版本:2.13
红色是一种R-based包结合交互式可视化和操纵的一个独立的Java应用程序的模块化结构,网络和多级嵌套层次关联。它实现了一个回调引擎使用低级R-to-Java接口来构建和运行常见的插件。从这个意义上讲,红色利用R健壮运行统计数据,而R-to-Java接口桥梁之间的差距网络分析和可视化。
作者:毛罗·卡斯特罗,鑫Wang Florian Markowetz
维护人员:毛罗·卡斯特罗< mauro.a。卡斯特罗在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“红”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“红”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“红”)
fig1.pdf | ||
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fig5a.pdf | ||
fig5b.pdf | ||
fig5c.pdf | ||
R脚本 | 主要装饰图案:嵌套网络的交互式可视化和操纵 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GraphsAndNetworks,NetworkVisualization,网络,软件,可视化 |
版本 | 1.10.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(> = 2.15),方法,igraph |
进口 | RCurl,XMLXMLRPC,rJava |
链接 | |
建议 | PANR,pvclust |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://genomebiology.com/2012/13/4/R29 |
取决于我 | Fletcher2013b |
进口我 | Mulder2012,研制 |
建议我 | PANR |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | RedeR_1.10.1.tar.gz |
Windows二进制 | RedeR_1.10.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | RedeR_1.10.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/reder/tree/release - 2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RedeR/ |
包下载报告 | 下载数据 |